Руководство FDA по тестированию на мутацию нового коронавируса
Jan 12, 2022FDA недавно опубликовало пересмотренные правила правоприменения в отношении утверждения тестов на молекулярный грипп и РСВ во время чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения, связанной с COVID-19. Поскольку во многих тестах на грипп и РСВ используются те же ингредиенты, что и для молекулярного анализа SARS CoV-2, эта политика была создана, чтобы помочь с нехваткой реагентов во время сезона гриппа. Эта политика поможет расширить доступ к одобренным FDA молекулярным тестам для обнаружения и характеристики вирусов гриппа, в том числе тех, которые идентифицируют РСВ.
Кроме того, в рамках серии «Виртуальная ратуша» FDA — «Эффективный немедленный выпуск руководства по диагностическому тестированию на коронавирус (COVID-19)» (формат Q&A) CAIVD перевела и выделила ключевой контент для развлечения читателей. В FDA около 100 человек участвуют в непосредственном рассмотрении EUA и Pre EUA, и за ними стоит большое количество сотрудников, которые помогают по-разному. Этот Q&A посвящен техническим вопросам, связанным с разработкой и проверкой тестов на SARS CoV-2 во время чрезвычайных ситуаций в области общественного здравоохранения. Краткое обновление было представлено д-ром Тимоти Стензелем, директором отдела диагностики in vitro и радиологического здоровья и заместителем директора отдела диагностики in vitro и радиологического здоровья отдела оценки продукции и качества CDRH.
Тимоти Стензел: На этой неделе мы одобрили ряд разрешений EUA, одно из наиболее конкретных — мы разрешили первый тест на антиген с помощью тест-полосок. Это обычная тест-полоска, которая помещается в пробирку и разрешена для тестирования в месте оказания медицинской помощи. Многие люди заинтересованы в этом простом и недорогом тесте, и этот тест-полоска на антиген даже не требует картриджа.
Это тест Quidel QuickVue SARS, и, как и BinaxNow от Abbott, это очень простой тест на антиген, для которого не требуется никакого оборудования. Мы считаем, что он уникален тем, что может значительно снизить стоимость получения результатов тестирования, поэтому его можно производить серийно, как BinaxNOW от Abbott.
Есть много других отличных продуктов для тестирования антигенов. Как правило, мы отдаем приоритет утверждениям приложений, которые имеют значительное влияние на общественное здравоохранение, таких как домашнее тестирование, домашний сбор, тестирование по месту оказания медицинской помощи и крупномасштабное тестирование в центральной лаборатории. В основном мы рассматриваем диагностические тесты, но также уделяем внимание серологическим тестам.
Еще одна тема, которую я хочу обсудить, — это новая мутация коронавируса. Варианты коронавируса в Великобритании также стали проблемой в США, где мы видели несколько подтвержденных случаев. Южноафриканский вариант имеет некоторые перекрывающиеся мутации с британским вариантом, но есть и явные различия.
Оба варианта кажутся высокозаразными из-за мутации вируса и усиления связывания с рецептором. Для этого есть доказательства, некоторые из которых могут иметь более высокую вирусную нагрузку, а затем сильнее связываться с рецепторами, оказывая большее влияние. Поэтому важно знать, какие варианты штаммов циркулируют. Мы заинтересованы в анализе на основе секвенирования, который обеспечивает полные последовательности генома. И мы получили лицензию по крайней мере на один из реагентов этого типа — наборы Illumina. Стоит отметить, что он был расширен до того, как мы поняли важность вариаций.
Еще одна вещь, которую делает FDA, — периодически требует от всех заявителей, особенно от тех, кто занимается молекулярными тестами, проверять последовательность известных вариантов по крайней мере дважды в процессе авторизации и уточнять свои праймеры об этих вариантах в известной базе данных и любых проблемах, которые могут возникнуть. может возникнуть из-за конструкции зонда.
Кроме того, FDA имеет возможности биоинформатического анализа. У нас есть список всех разрешенных EUA молекулярных праймеров и зондов. Мы запрашивали базы данных секвенирования, чтобы узнать, есть ли какие-либо мутации, которые могут повлиять на производительность теста. Мы проанализировали мутантные штаммы, появившиеся в Великобритании и Южной Африке. Мы также делали это раньше для любых вариантов, появляющихся в базе данных, которые составляют 5% или более последовательности в базе данных.
По крайней мере, один тест нового британского варианта коронавируса, о котором мы говорили сегодня, был публично упомянут как анализ пути атаки Thermofisher с делецией гена S. Из-за делеции гена S мы исследовали множество вариантов и последовательностей в базе данных США. Пока что большинство не имеет характеристик британского варианта. В настоящее время в США существует только одно подмножество — делеция гена S Термофишера. Мы полагаем, что примерно у 5% пациентов с положительным результатом на Термофишер есть делеции гена S. Однако мы считаем, что на сегодняшний день подавляющее большинство не имеет британского варианта. Поэтому в настоящее время мы рекомендуем, по крайней мере, проверку последовательности образцов с делецией гена S, и анализ секвенирования, одобренный Illumina EUA, может удовлетворить это требование.
01
В1: При использовании молекулярного теста в качестве компаратора для экспресс-тестирования на антиген, какое пороговое значение КТ, связанное с инфекционностью, подходит для целей отчетности?
A: Мы не использовали отсечки CT или какие-то инфекционные отсечки, потому что на самом деле CT сильно различаются. Для экспресс-тестирования на антиген мы обнаружили, что CT достигает 40 в первые пять дней появления симптомов. Точная причина еще не установлена. Но мы очень четко видели, что в первые пять-семь дней появления симптомов были некоторые высокие результаты КТ. Поэтому мы считаем важным знать истинные результаты теста на антиген при появлении симптомов.
Поэтому мы рекомендуем прямое тестирование на антиген. Большинство тестов одобрены для симптоматического периода от пяти до семи дней. Мы хотим знать, какова частота обнаружения у пациентов, прошедших тестирование на антиген и получивших положительный результат на Covid-19.
02
В2: Если клиническая валидация используется в качестве скринингового теста, каково минимальное рекомендуемое количество положительных и отрицательных случаев ПЦР?
О: Если вы проводите бессимптомный скрининг, и это ваше первое и единственное исследование, то, я думаю, вам нужно 30 положительных случаев. Если вы хотите добавить его в авторизованные проверки или синхронизировать с первым периодом авторизации EUA. Мы считаем, что минимум зависит от наличия не менее 10 положительных случаев бессимптомных пациентов до выхода на рынок или до получения разрешения.
Если вы собираетесь пройти тест на антиген, рекомендуется провести исследование, чтобы получить максимальную отдачу от того, что на самом деле делают бессимптомные люди. Итак, как я уже сказал, пик тестирования на антиген приходится на первые пять-семь дней появления симптомов. Уровни вируса и скрытые всплески внутри них обычно достигают пика в этот период. Это может быть немного раньше, но обычно не задерживается. После недели сокрытия вируса эффективность обнаружения антигена снизилась. Хотя хороший молекулярный тест может быть положительным через 14 дней, в некоторых случаях развиваются симптомы, которые выходят за рамки симптоматических исследований.
Таким образом, оптимальная схема исследования состоит в том, чтобы связать серию последовательных анализов, что даст вам наилучшие шансы продемонстрировать превосходные результаты анализов на антигены. Скрининг не реже одного раза в неделю с молекулярным компаратором, который можно использовать в качестве документированного компаратора для бессимптомных исследований. Таким образом, вы можете обогатить свою базу данных, ожидая, пока кто-нибудь подтвердит положительный результат проверки. Свяжитесь с людьми, которые дали положительный результат, чтобы узнать, хотят ли они пройти тестирование на новый тест. Желательно использовать как минимум одинаковое количество негативов для обеспечения надежности. Возможно, это лучший способ повысить уровень бессимптомного вируса, чтобы увидеть лучшие результаты тестов на антигены.
03
Q3: Каков приоритет одобрения EUA для различных тестов?
A: POCT-тестирование, домашнее тестирование, домашнее взятие проб, в основном сосредоточенное на диагностическом тестировании, а именно на молекулярном и антигенном тестировании. Но серологическое тестирование также будет приоритетным. За этим следуют высокопроизводительные центральные лабораторные испытания, которые помогают сократить время обработки результатов испытаний на автоматизированных платформах или автоматизированных системах. Это приоритеты.
04
Q4: Что касается серологии, в связи с внедрением в настоящее время вакцинации, что FDA может сказать о серологическом тестировании вакцинированных лиц?
О: Вакцины рассматриваются Центром оценки и исследований биологических препаратов (CBER), и вопросы необходимо направлять в центр для получения ответов. Серологию можно предсказать различными способами на основе известных данных, что важно для рассмотрения любой заявки, связанной с вакциной. Нет запрета на его оценку в различных серологических тестах, используемых лицензированными клиницистами. Следует иметь в виду, что в настоящее время FDA не разрешает серологические тесты для каких-либо целей, будь то для определения необходимости вакцины или для определения того, что вакцина эффективна или что иммунитет установлен. Серологическое тестирование также не разрешено для целей иммунизации. FDA одобрило полуколичественные серологические тесты и серологические реагенты с нейтрализующими антителами.
05
В5: Как будет проводиться серологическое тестирование вакцинированных людей и будут ли ложноположительные результаты? Если кто-то был вакцинирован, можно ли сказать, что антитела были выработаны?
О: В настоящее время такие реагенты не разрешены. Разработка вакцинных антител может быть очень похожа на разработку настоящих новых антител к коронной инфекции. Это очень важный тест, требующий особых требований. FDA рассмотрит дизайн, но все еще требует нескольких соображений.
06
В6: Что касается использования контроля качества, каковы рекомендации FDA в отношении внутренних стандартов тестирования на антигены?
О: Существует внутренний стандарт для оценки качества образца, но это не является требованием для авторизации EUA. Единственным требованием или рекомендацией для такого внутреннего стандарта до сих пор был сбор образцов на дому, и мы не знаем, собрали ли пациенты достаточно хорошие образцы для анализа без контроля внутреннего стандарта. FDA обновило некоторые разрешения программами внутренних стандартов, оценило эффективность домашних тестов, рассмотрело тысячи данных и в некоторых случаях больше не требует внутренних стандартов. Но теперь, когда появились новые R&D объекты и новые коллекции домашних хозяйств, мы хотели бы видеть эти данные.
07
В7: Можете ли вы прокомментировать приемлемую стратегию обогащения экспресс-тестов на антигены, особенно скрининг всех, кто приходит в центр тестирования на COVID, на наличие симптомов инфекции COVID-19?
Мы ищем положительные случаи, некоторые с симптомами и некоторые без симптомов. Чтобы попытаться получить заявление с положительными симптомами, а не с отсутствием симптомов, мы хотели провести скрининг людей, у которых были симптомы в течение последних 8 дней или у которых симптомы появились 8 дней назад.
A: Я не думаю, что это особенно хороший план исследования. Из-за текущего высокого показателя положительных результатов, пока наблюдаются пациенты с симптомами, можно получить не менее 30 положительных результатов. У нас есть большая гибкость в бессимптомном выявлении. Для качественной работы по обнаружению антигена это должна быть группа непрерывного обнаружения, которая обеспечит наилучшие возможности для обнаружения антигена и продемонстрирует свое превосходство в первые 5-7 дней сокрытия вируса. Представление. Если вы хотите продолжить, вам необходимо отправить заявку Pre-EUA на рассмотрение, но это не рекомендуется.
08
Вопрос 8: CDC согласился провести некоторые тесты на британских мутантах нового коронавируса в сравнении с существующими тестами, одобренными EUA. Справедливо ли это также для разработчиков, разрабатывающих тесты на антигены?
A: Я думаю, что подходящее время может быть после того, как анализ будет заблокирован. Вы также можете самостоятельно сконструировать псевдовирусы для оценки, поскольку в библиотеке BEI в конечном итоге может присутствовать британско-положительный мутировавший живой вирус и/или облученный или активированный гем вирус. Но я не думаю, что необходимо перегружать CDC на ранних этапах разработки.
Важно, что мы надеемся, что все тесты на антигены не будут затронуты. Я думаю, что мы могли бы получить хорошее направление с первым тестом, который мы сделали. Обычно анализы на антиген нацелены на ген N, который в некоторых отношениях может быть гораздо более консервативным, чем белок spec.
Но как только вы его заблокируете и будете готовы к фиксации, я начну проверять его ход. Потому что в этот момент для нас в FDA также было бы очень полезно иметь возможность немедленно понять и отреагировать на реагенты, которые оценивают тесты на британский вариант. Мы хотим следить за процессом разработки продукта вместе с вами.
09
В9: Если у нас есть разрешение на проведение клинического валидационного исследования, применимо ли это также к 510(k)?
О: После того, как первый тест De Novo будет одобрен по молекулярной или любой другой соответствующей классификации, каждый последующий тест будет представлен в 510(k). Для тех разработчиков, которые хотят понять свои требования к преобразованию, мы готовим руководство, но конкретные сведения обо всех продуктах EUA могут быть не полностью отражены в первом проекте.
Поэтому мы попросили команду подготовить некоторую информацию, которой можно было бы поделиться с разработчиками. Во-первых, SARS-CoV-2 отличается от стандартных антигенов при других инфекционных заболеваниях серологическим и/или молекулярным определением респираторных инфекционных антигенов. Поэтому наша обратная связь будет сосредоточена на том, чем Covid отличается от нашей реакции. Мы настоятельно рекомендуем вам ознакомиться с нашим кратким изложением последних решений по делу De Novos и 510(k), которое включает все часто задаваемые вопросы о специальных мерах контроля, связанных с тестированием на респираторные вирусы.
Я не думаю, что есть какая-то спешка с преобразованием EUA в 510(k). Потому что прямо сейчас у нас есть много заявок на участие в EUA, которые нужно обработать, и каждую неделю появляется много новых заявок. Таким образом, наше внимание сейчас по-прежнему будет сосредоточено в основном на авторизации EUA. Даже если это закончится, руководящие принципы, которые мы разрабатываем, обеспечат очень разумное время перехода, поэтому мы не думаем, что во время перехода произойдут необоснованные вещи.
Но я очень хорошо знаю, что нам потребуется много преобразований, поэтому всем разработчикам будет разумно начать думать об этих преобразованиях. Если для вас важен переход в важный момент перехода, во время текущей пандемии COVID-19 можно собрать образцы для трансляционных исследований в рамках подготовки к переходу вашего EUA на 510(k).
10
В10: Есть ли у вас какие-либо указания или информация о том, что распространяющаяся мутация может повлиять на праймеры CDC?
О: Да. Как только мы выявим потенциальное влияние на молекулярное, антигенное или серологическое тестирование, мы обнародуем эту информацию как можно скорее. Последовательности праймеров и зондов для анализа CDC были опубликованы, и вы можете просмотреть и понять мутации и то, как они влияют на эти праймеры и зонды.
первоисточник
Серия виртуальных ратушей FDA– Немедленно вступившие в силу рекомендации по диагностическим тестам на коронавирус (COVID-19)
Источник: официальный сайт FDA.